מינהלת סל"ע הינה מינהלת ביצוע במשרד ראש הממשלה והוקמה לפי החלטת הממשלה מס' 1996 מיום 6.6.2004.

הצעת החוק ליישום תוכנית ההתנתקות התשס"ה – 2005, אשר אושרה בקריאה ראשונה על ידי מליאת הכנסת ביום י"ט בחשוון תשס"ה - 3.11.2004, מייחדת פרק שלם לפעילות המינהלה, תפקידיה וסמכויותיה.(להלן-"החוק")

בראש המינהלה עומדת כיום הגברת צביה שמעון.

המינהלה אחראית על ביצוע החוק ותפקידיה המרכזיים במסגרת זו הינם מתן פיצויים לזכאים, סיוע במעבר למקומות מגורים חדשים ובתעסוקה חדשה, והעתקת מקומות מגורים של קבוצות מתיישבים למקומות חלופיים.